suite de la rédaction des exercices sur le module 08

Author: GuyliannEngels

analysis/fish_mfa.Rmd

@@ -15,11 +15,11 @@ Ce document s'intéresse à la réalisation d'une AFM. Cet exercice se base sur
 
 # Jeu de données
 
-Les jeux de données employés sont à votre disposition dans le dossier `data`. Les plus attentifs d'entre vous auront remarqué une similitude avec les jeux de données proposés dans la list `doubs` du package `ade4`. En effet, les données qui vont sont proposées dérivent du `doubs`
+Les jeux de données employés sont à votre disposition dans le dossier `data`. Les plus attentifs d'entre vous auront remarqué une similitude avec les jeux de données proposés dans la list `doubs` du package `ade4`. En effet, les données qui vont sont proposées dérivent du `doubs`.
 
 # Analyses
 
-> Avant de débuter votre analyse, ajoutez dans le code SciViews lié à l'AFM mis à votre disposition dans le bookdown : <http://biodatascience-course.sciviews.org/sdd-umons2/analyse-factorielle-multiple-afm.html>
+> Avant de débuter votre analyse, ajoute le code SciViews lié à l'AFM mis à votre disposition dans le bookdown : <http://biodatascience-course.sciviews.org/sdd-umons2/analyse-factorielle-multiple-afm.html>
 
 ```{r sciviews-mfa}
 
@@ -32,11 +32,6 @@ spe <- read()
 envi <- read()
 ```
 
-> Si vos tableaux comprennent une colonne relative au station, transformez cette dernière en nom des lignes avec la fonction `column_to_rownames()`. Vous pouvez également prendre la décision de supprimer cette colonne.
-
-```{r rownames}
-```
-
 > Utilisez les fonctions ci-dessous afin de découvrir les données. Répondez au questions suivantes : Combien y a t'il de stations ? Combien y a t'il d'espèces étudiées ? Quels est le nombre maximum d'observations sur le stations (sans tenir compte des espèces.) ? Y a t'il une station qui sans aucune observations d'oiseaux recensés ? ... Commentez en maximum 4 lignes.
 
 ```{r}
@@ -70,7 +65,7 @@ spe_env <-
 
 > Maintenant que vous avez un tableau de données unique (**astuce: votre tableau doit comprendre 29). Vous pouvez réalisez votre MFA.
 
-> Nous allons débuter par réaliser 3 groupes dans nos données : le groupe lié à la communauté de poisson, le groupe lié à la géogrpahie et le groupe lié à la qualité de l'eau. Utilisez le nom et la signification des variables pour définir vos trois groupes.
+> Nous allons débuter par réaliser 3 groupes dans nos données : le groupe lié à la communauté de poisson, le groupe lié à la géographie et le groupe lié à la qualité de l'eau. Utilisez le nom et la signification des variables pour définir vos trois groupes.
 
 ```{r}
 names(spe_env)

analysis/open_data.Rmd

@@ -0,0 +1,30 @@
+---
+title: "Open Data"
+author: '...'
+date: "3/29/2020"
+output:
+  pdf_document: default
+---
+
+```{r setup, include=FALSE}
+knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
+```
+
+# Objectif
+
+Suite à la lecture de la section sur la gestion des données avec le principe *FAIR*. Rédigez un document de synthèse de *maximum 3 pages* au format pdf qui critique votre plan de gestion des données réalisée dans le cadre des données obtenues sur la biométrie humaine. Cette critique doit répondre à 2 questions :
+
+- Quelles sont les bonnes pratiques que vous avez employées ? 
+- Quels sont les éléments que vous devriez améliorer à l'avenir dans un prochain plan de gestion des données ? 
+
+Dans le cadre du cours de science des données biologiques I, vous avez donc du concevoir un plan d’expérience afin d’acquérir des données. Etant donnée que vous avez été des scientifiques consciencieux, vous avez collecté vos données en y associant des métadonnées.
+
+Les données ont été collectée via un document googlesheet dont l’url est le suivant:
+
+- <https://docs.google.com/spreadsheets/d/1UfpZvx1_nd7d10vIMAfGVZ1vWyIuzeiKxPL0jfkNSQM/edit#gid=0>
+
+Les métadonnées associées aux données ont été recensées dans un document googledoc dont l’url est le suivant:
+
+- <https://docs.google.com/document/d/1lgYD39W7vmVYyS5ea0wEl9ArE1dhuDRkIIBzZ4K6d_o/edit>
+
+# Critique de la gestion de données