From 101ffd503563da5e94454c790b907a0fc600e2f9 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Fri, 18 Aug 2023 16:27:53 -0300
Subject: [PATCH 1/7] Update: Change Python file Test

---
 test/dna-test.py | 0
 1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
 create mode 100644 test/dna-test.py

diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
new file mode 100644
index 0000000..e69de29

From 0d6caa42d5a9f8b01d8b4f25db710322f6219bfe Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Sun, 20 Aug 2023 07:53:59 -0300
Subject: [PATCH 2/7] Update: Change Libraries

---
 test/dna-test.py | 6 ++++++
 1 file changed, 6 insertions(+)

diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
index e69de29..834f6aa 100644
--- a/test/dna-test.py
+++ b/test/dna-test.py
@@ -0,0 +1,6 @@
+import numpy as np
+from Bio.PDB import PDBParser
+from OpenGL.GL import *
+from OpenGL.GLUT import *
+from OpenGL.GLU import *
+

From 8a3aed876ce7347f70514834b8e55b3db969d446 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Sun, 20 Aug 2023 08:07:42 -0300
Subject: [PATCH 3/7] Update: Setting the conts for viewing (window/camera)

---
 test/dna-test.py | 11 +++++++++++
 1 file changed, 11 insertions(+)

diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
index 834f6aa..225a736 100644
--- a/test/dna-test.py
+++ b/test/dna-test.py
@@ -4,3 +4,14 @@
 from OpenGL.GLUT import *
 from OpenGL.GLU import *
 
+# Defininfo as conts para visualização (janela/camera)
+WINDOW_TITLE = "DNA Humano"
+WINDOW_WIDTH = 800
+WINDOW_HEIGHT = 600
+FOV = 45
+NEAR = 1
+FAR = 50
+CAMERA_POS = (0, 0, -15)
+CAMERA_TARGET = (0, 0, 0)
+CAMERA_UP = (0, 1, 0)
+

From 991dfa176c1cac4a14c7c50f534d5d5a672aa9da Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Sun, 20 Aug 2023 08:13:30 -0300
Subject: [PATCH 4/7] Update: Defining a function to load the structure of DNA
 from a PDB file

---
 test/dna-test.py | 10 +++++++++-
 1 file changed, 9 insertions(+), 1 deletion(-)

diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
index 225a736..d60b8ce 100644
--- a/test/dna-test.py
+++ b/test/dna-test.py
@@ -4,7 +4,7 @@
 from OpenGL.GLUT import *
 from OpenGL.GLU import *
 
-# Defininfo as conts para visualização (janela/camera)
+# Definindo as conts para visualização (janela/camera)
 WINDOW_TITLE = "DNA Humano"
 WINDOW_WIDTH = 800
 WINDOW_HEIGHT = 600
@@ -15,3 +15,11 @@
 CAMERA_TARGET = (0, 0, 0)
 CAMERA_UP = (0, 1, 0)
 
+# Definindo uma função para carregar a estrutura do DNA a partir de um arquivo PDB
+def load_dna_structure(pdb_file):
+  parser = PDBParser(QUIET=True)
+  structure = parser.get_structure('DNA', pdb_file)
+  model = structure[0]
+  return model
+
+# Definindo uma função para desenhar a estrutura do DNA usando linhas
\ No newline at end of file

From ea46c48742e229a2c3516507618719499e0bd500 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Sun, 20 Aug 2023 08:23:12 -0300
Subject: [PATCH 5/7] Update: Defining a function to draw the structure of DNA
 using lines

---
 test/dna-test.py | 12 +++++++++++-
 1 file changed, 11 insertions(+), 1 deletion(-)

diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
index d60b8ce..3246678 100644
--- a/test/dna-test.py
+++ b/test/dna-test.py
@@ -22,4 +22,14 @@ def load_dna_structure(pdb_file):
   model = structure[0]
   return model
 
-# Definindo uma função para desenhar a estrutura do DNA usando linhas
\ No newline at end of file
+# Definindo uma função para desenhar a estrutura do DNA usando linhas
+def draw_dna_model(model):
+  glLineWidth(2.0)
+  glBegin(GL_LINE)
+  for chain in model.get_chains():
+    for residue in chain:
+      for atom in residue:
+        if atom.get_name() == "p":
+          x, y, z = atom.get_coord()
+          glVertex3f(x, y, z)
+  glEnd()
\ No newline at end of file

From 36b069d96bec6e609df19ebe7b39f1354e83b113 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: sameckmatheus <sameckmatheuspro@gmail.com>
Date: Sun, 20 Aug 2023 08:40:09 -0300
Subject: [PATCH 6/7] Update: dna-test.py and remove dna.py

---
 dna.py           | 53 ------------------------------------------------
 test/dna-test.py |  3 ++-
 2 files changed, 2 insertions(+), 54 deletions(-)
 delete mode 100644 dna.py

diff --git a/dna.py b/dna.py
deleted file mode 100644
index 60e6b7e..0000000
--- a/dna.py
+++ /dev/null
@@ -1,53 +0,0 @@
-import numpy as np
-from Bio.PDB import PDBParser
-from OpenGL.GL import *
-from OpenGL.GLUT import *
-from OpenGL.GLU import *
-
-def load_dna_structure(pdb_file):
-  parser = PDBParser(QUIET=True)
-  structure = parser.get_structure('DNA', pdb_file)
-  model = structure[0]
-  return model
-
-# Inicializando a janela OpenGL
-def draw_dna_model(model):
-  glutInit()
-  glutInitDisplayMode(GLUT_SINGLE | GLUT_RGB)
-  glutCreateWindow("Representação do DNA humano")
-
-  # Inicializando a renderização da janela
-  def render():
-    glClear(GL_COLOR_BUFFER_CLEAR)
-    glRotatef(1, 3, 1, 1)
-
-    glLineWidth(2.0)
-    glBegin(GL_LINES)
-    for chain in model.get_chains():
-      for residue in chain:
-        for atom in residue:
-          if atom.get_name() == "p":
-            x, y, z = atom.get_coord()
-            glVertex3f(x, y, z)
-    glEnd()
-    glFlush()
-    
-  # Inicializando a matriz de projeção
-  glMatrixMode(GL_PROJECTION)
-  glLoadIdentity()
-  gluPerspective(45, (800 / 600), 1, 50)
-
-  # Definindo a posição do observador
-  glMatrixMode(GL_MODELVIEW)
-  glLoadIdentity()
-  gluLookAt(0, 0, -15, 0, 0, 0, 0, 1, 0)
-
-  # Iniciando o loop de renderização
-  glutDisplayFunc(render)
-  glutIdleFunc(render)
-  glutMainLoop()
-
-if __name__ == "__main__":
-  # Substituindo "dna.pdb" pelo caminho do arquivo PDB que contém a estrutura do DNA
-  dna_structure = load_dna_structure("dna.pdb")
-  draw_dna_model(dna_structure)
\ No newline at end of file
diff --git a/test/dna-test.py b/test/dna-test.py
index 3246678..bac4c7b 100644
--- a/test/dna-test.py
+++ b/test/dna-test.py
@@ -32,4 +32,5 @@ def draw_dna_model(model):
         if atom.get_name() == "p":
           x, y, z = atom.get_coord()
           glVertex3f(x, y, z)
-  glEnd()
\ No newline at end of file
+  glEnd()
+

From 37e1bec3ffa50001d6e754fcc977eed9618fce24 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Matheus Sameck <105814501+sameckmatheus@users.noreply.github.com>
Date: Tue, 19 Sep 2023 16:53:00 -0300
Subject: [PATCH 7/7] Update README.md

---
 README.md | 24 ++++++++++++++++++++++--
 1 file changed, 22 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/README.md b/README.md
index be2c69d..a35b483 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -1,3 +1,23 @@
-# 3D_DNA
+# Modelo 3D do DNA com Biopython e PyOpenGL
 
-Modelo 3D do DNA utilizando as bibliotecas Biopython e  PyOpenGL para criar uma representação gráfica do elemento em questão
+Este projeto consiste em utilizar as bibliotecas Biopython e PyOpenGL para criar um modelo em 3D do DNA.
+
+## Pré-requisitos
+
+Antes de executar o projeto, é necessário instalar as bibliotecas Biopython e PyOpenGL. Você pode fazer isso através dos seguintes comandos:
+
+    pip install biopython
+    pip install PyOpenGL 
+    pip install PyOpenGL_accelerate
+
+Além disso, é importante ter um conhecimento básico em Biologia Molecular e programação em Python.
+
+## Utilização
+
+Para utilizar o modelo 3D do DNA, execute o arquivo `dna_model.py` através do terminal ou de um ambiente de desenvolvimento Python. O modelo será exibido em uma janela gráfica.
+
+Caso deseje mudar as configurações do modelo, como a posição do observador e o zoom, altere os valores das constantes no início do arquivo `dna_model.py`.
+
+## Licença
+
+Este projeto está licenciado sob a licença \[MIT]. Leia o arquivo LICENSE para mais detalhes.